Определение генетического полиморфизма
Наиболее точное определение генетического полиморфизма приводит в своей книге В. С. Баранов, определяя генетический полиморфизм как «генетическую изменчивость, ограниченную одним видом (Homosapiens в нашем случае)». Генетический полиморфизм может быть качественным, когда происходят замены нуклеотидов, либо количественным, когда в ДНК варьирует число нуклеотидных повторов различной протяженности.
Однонуклеотидный полиморфизм (ОНП) является наиболее востребованным типом генетических вариаций, анализ которых представляет существенный практический интерес. По сравнению с другими типами вариабельности, такими как микросателлитные повторы, делеции или инсерции, точечные нуклеотидные замены наиболее широко представлены в геноме. При этом, несмотря на минимальное изменение структуры ДНК, они могут приводить к существенным изменениям свойств кодируемых генами пептидов.
Все особи одного вида имеют схожий геном, но при этом обладают различными внешними признаками (фенотипом), причём различия заметны уже с момента рождения. В среднем однонуклеотидные различия между геномами двух людей обнаруживаются в количестве 1 на 1000 оснований, при этом во всём человеческом геноме приблизительно 3 миллиарда пар нуклеотидов.
Каждый полиморфизм обладает минорным и мажорным состояниями (причём они могут быть как заменами, так и вставками/делециями), а также может обладать и промежуточными состояниями. Было показано, что нуклеотидные полиморфизмы влияют не только на фенотип, но и на устойчивость организмов к различным заболеваниям и внешним воздействиям, на скорость синтеза и распада различных веществ в организме, действие фармпрепаратов.
Сейчас известно более 187 миллионов полиморфизмов генома человека (согласно dbSNP — базы данных по нуклеотидным полиморфизмам). Те полиморфизмы, каждая из аллелей которых встречается более чем у 0,01% человечества, были пронумерованы с использованием индекса rs.
Минимальность структурных изменений, которую обусловливают нуклеотидные полиморфизмы, диктует необходимость использования особо точных методов, которые позволяют регистрировать такие изменения. С другой стороны, информативность такого (базирующегося на ОНП) анализа будет высока только при использовании высокопроизводительных технологий анализа, позволяющих анализировать в приемлемый срок тысячи полиморфизмов.
На сегодняшний день широко используются несколько подходов, которые в зависимости от поставленной задачи позволяют точно осуществить генетический анализ. Это и традиционно использующийся метод анализа длин рестрикционных фрагментов (ПЦР-ПДРФ), минисеквенирование ДНК.
А также более современные и высокопроизводительные подходы, такие как масс-спектрометрическое минисеквенирование, полногеномное секвенирование, секвенирование экзомов и генотипирование на высокоплотных чипах.
- Генетическое тестирование при назначении психофармакотерапии
- Основные методики психических расстройств
- Назначение антипсихотиков
- Применение фармакогенетического тестирования при назначении антидепрессантов
- Показания для применения фармакогенетического теста при назначении антидепрессантов
- Факторы фармакодинамические и генетические
- Фармакокинетические факторы
- Полногеномные ассоциативные исследования GWAS
- Литий и циркадные ритмы
- Оформление отчета по практике по ГОСТу 2021/2022
- Оформление ВКР по ГОСТу
- Как составить бизнес-план своими силами
- Оформление эссе по ГОСТу
- Оформление презентации по ГОСТу
- Оформление статьи по ГОСТу
- Оформление дипломной работы по ГОСТ 2021/2022
- Оформление курсовой работы по ГОСТу
- Оформление контрольной работы по ГОСТу